Akademia Morska w Szczecinie pozyskała 5 mln zł z Narodowego Centrum Badań i Rozwoju na unowocześnienie systemów zarządzania. Dzięki temu już w 2014 r. będzie jedną z najnowocześniej zarządzanych uczelni w Polsce.
W listopadzie 2011 r. NCBiR ogłosiło konkurs w ramach działania 4.1.1 Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki na rozwój uczelni. Do konkursu o 150 mln zł stanęło 206 uczelni z całej Polski. Do oceny merytorycznej dopuszczono 186 z nich. Konkurs rozstrzygnięto 8 maja 2012 r. Dofinansowanie otrzymały 33 szkoły wyższe w tym Akademia Morska w Szczecinie zajmując na liście rankingowej wysokie 3 miejsce w Polsce i pozyskując prawie 5 mln zł. Pozostałe uczelnie z województwa zachodniopomorskiego nie zdobyły dofinansowania.
Dzięki środkom z Unii Europejskiej w Akademii wdrożony zostanie zintegrowany system informatyczny składający się z 10 modułów, które będą ze sobą ściśle współpracowały. W efekcie większość spraw załatwiana będzie elektronicznie co zdecydowanie przyspieszy i usprawni funkcjonowanie uczelni. Zanim to jednak nastąpi, zewnętrzna firma doradcza przeprowadzi szczegółowy audyt procesów realizowanych w poszczególnych działach. Następnie procesy te zostaną zmapowane w specjalnym programie komputerowym, uproszczone i na końcu zaimplementowane do zintegrowanego systemu informatycznego. Oprócz wdrożenia tego systemu, w ramach projektu przewidziano studia podyplomowe oraz szkolenia z zakresu zarządzania dla kadry kierowniczej AM.
Realizacja projektu rozpocznie się w styczniu 2013 r. i potrwa do końca 2014 r.